裸子植物有真正的花,裸子植物开的并不是“花”,而属于孢子叶球。花有四部分组成,即花冠、花萼、花托、花蕊,如果一朵花拥有这四部分中的全部,就叫做完全花,而如果缺少了其中的任何一部分,则被称为不完全花。所有的被子植物都拥有花,无论是完全花也好还是不完全花也好,因此被子植物又被称为“显花植物”或者“有花植物”。
但是裸子植物并不具备“花”,它们的胚珠外面没有子房壁包被,不形成果皮,种子是裸露的,故称裸子植物。因此并不能称它为真正的“开花”植物。
裸子植物除少数类群(如买麻藤属及松科的一些属)外,均具有双黄酮类化合物,常见的有穗花杉双黄酮、西阿多黄素、银杏黄素、枯黄素、榧黄素等。黄酮类化合物则普遍存在,常见的有懈皮素、山奈酚和杨梅树皮素等。生物碱仅在三尖杉科、麻黄科和买麻藤科中存在,可供药用。苏铁科、红豆杉科和罗汉松科的部分属种可供观赏,其他种类多为高大乔木,其树干通直,出材率高,材质较优良,供建筑、家具及工业用材,占世界木材供应量的50%以上;部分树种可割制松香和提取松节油;少数树种的种子可食;部分树种为速生造林树种或园林绿化树种;生于江河上游的为水源林;生于高山陡坡的可防止雨水冲刷。